喬納遜·伯內斯說：「公元前347年，他突然離開了該城。關於他離去的原因沒有可靠的報道。但是，希臘北方重鎮奧林索斯於公元前348年落入馬其頓軍隊之手。德摩斯梯尼及其反馬其頓派在一片反馬其頓的怒潮聲中執掌了雅典的政權。很可能是政治上的問題使亞里士多德在公元前347年離境而去，正如他們在公元前323年使他再次離去一樣。」②
②（英）喬納遜·伯內斯：《亞里士多德》，中國社會科學出版社，1989年版，第16-17頁。
不管怎樣解釋，反正亞里士多德是在柏拉圖死後離開雅典前往阿塔內斯的。從此，開始了12年的遊歷生活。

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亞里士多德遊歷的第一個存身之地是密細亞地區的阿塔內斯，是受赫爾米亞之邀前來的。赫爾米亞是個聲名不佳的人物。他開始依附於波斯，後來又和腓力普往來。作為一個朋友，赫爾米亞倒是忠肝義膽，精明強幹。他出身於奴隷，學習了文化，作過內廷侍從。後來在密細亞地區伊達山中經營採礦，獲了巨利，成為富豪，買通了波斯王朝，取得這一地帶的主權。赫爾米亞曾在阿加德米學習過，對柏拉圖的理想——或者哲學家為王，或者王者成為哲學家——很是嚮往。當他自身果然手握權柄，專制一方的時候，就從阿加德米請來四位哲學家：亞里士多德、克賽諾克拉提、柯裡斯柯斯、埃拉托斯。四人被安排在阿索斯海濱，讓他們潛心討論哲學，赫爾米亞一切必需品。他們似乎不曾開設講壇，招收學生。在這裡，亞里士多德開始批判柏拉圖的哲學，逐漸形成自己的獨立見解。

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在阿索斯，亞里士多德與赫爾米亞的侄女（也有說是女兒、養女、妹妹的）比娣婭結了婚。這次婚姻給亞里士多德帶來一筆可觀的嫁資。婚後生有一女，也取名為比娣婭。這個妻子早年去世，亞里士多德後來又和斯塔吉拉的名叫赫比麗絲的女子結婚，生一子，取名尼各馬科，與祖父同名。關於第二個妻子的情況，包括何時結婚，在何地結婚，無處記載。其家庭生活，也無詳細材料。
時間不長，大概到第三年，亞里士多德移居累斯博斯島東南角上的城市米提利尼。在這裡他結識了此後25年共同合作，形影不離，又是他學園繼承人的泰奧弗拉斯特。泰奧弗拉斯特大概生於公元前370年，比亞里士多德小14歲。亞里士多德研究者中最激進的人甚至認為，現存亞里士多德著作，多數出自泰奧弗拉斯特之手。他們二人在小亞細亞的工作，比較可靠的推測是，對這一帶的海生動物進行了較廣泛的考察，因為在他們的動物學著作裡經常提到這一帶的地名，特別是島上的一處名為普拉的珊瑚礁地帶。不過那些卷帙浩繁的動物學著作，恐怕也不是短短三五年所能完成的①。

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