初，呂夷簡罷相，夏竦為樞密使，復奪之，代以杜衍，同時進用富弼、韓琦、范仲淹等。石介作《慶歷聖德詩》，言退奸不易，進賢之難，而終篇意在夏竦。竦尤不悅，因與其黨造為黨論，目仲淹、衍及修為黨人。修乃上《朋黨論》，其大略言：「小人無朋，惟君子則有之。蓋小人所好者利祿，所貪者財貨，當其同利之時，暫相黨引以為朋，及其見利而爭先，或利盡而交疏，則反相賊害，雖其兄弟親戚不能相保，故曰小人無朋。君子則不然，所守者道義，所行者忠信，所惜者名節，以之修身則同道而相益，以之事國則同心而共濟，終始如一，故君子有朋也。」又上疏言：「杜衍、韓琦、范仲淹、富弼相繼罷去，天下皆知其有可用之賢，而不聞其有可罷之罪。自古小人讒害忠賢，其說不遠。欲廣陷良善，不過指為朋黨；欲動搖大臣，必須誣以專權。其故何也？去一善人，而眾善人尚在，則未為小人之利。欲盡去之，則善人少過，難為一一求瑕。唯是指以為朋，則可一時盡逐。至如自古大臣已被主知而蒙信任，則難以他事動搖，惟有專權是上之所惡，必須此語方可傾之。正士在朝，群邪所忌；謀臣不用，敵國之福也。今此四人一旦罷去，而使群邪相賀于內，四夷相賀于外，臣所以為陛下惜之也。」為黨論者，尤惡修異己，又善言其情狀，至使內侍藍元震上疏言：「范仲淹、歐陽修、尹洙、余靖，前日蔡襄謂之『四賢』，斥去未幾，復升天衢。『四賢』得時，遂引蔡襄以為同列，下則以國家爵祿為己私惠，上則朋黨膠漆皆聚本朝。設使逐人私黨，不過十數，同心醜正，已為五六十人，相依為重，將紊紀綱。九重至深，萬機至重，何由察知？」賴仁宗終不之信。

修之使河東，以陝西用兵久，河東芻糧不足，言者請廢麟州，或請移治合河津，或請廢五寨。修為四議以較麟州利害，請移兵就食于濱河清塞堡，緩急不失應援，平時可省饋運，麟州得不廢。又建言忻、代、岢嵐、火山四郡有禁地，棄而不耕，民私糴虜中，以應軍須，今悉耕之，歲可得數百萬石以實邊。又言河東民故貧，軍興以來賦斂尤重，行路嗟怨，條上可罷者數十事，以寬民力。

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修自河東還，會保州兵叛，出修為龍圖閣直學士、河北都轉運使。保州平，大將李昭亮私納婦女，通判馮博文等竊效之。修捕博文系獄，昭亮皇恐，立出之。自保州之變，河北兵驕，小不可意則思亂，人情務在姑息。修乞假將帥權重，以消未萌。保塞之脅從者二千餘人，分隷河北，夏竦為宣撫使，曰是去禍而遺根也，欲以便宜誅之。修權知成德軍，遇之於內黃，竦夜半屏人以告修。修曰：「禍莫大於殺降。昨保州叛卒，朝廷許以不死，今戮之矣。此曹本以脅從故得脫，奈何一旦殺無辜二千人？既非朝旨，諸郡且不肯從，緩之則籍籍必生變，是趣之為亂也。」遂止。河決澶淵，陳執中欲塞商胡，決橫隴故道。修言功大必不可成，徒勞人。執中罷，文彥博復用李仲昌議，欲開六塔河。修言六塔河不能吞伏，且複決，再爭之不得，既而濱、棣、德、博數千里皆被害。

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初，修出河北，仁宗面諭曰：「勿為久居計。有事言來。」修對曰：「諫官乃得風聞，今在外，使事有指，越職罪也。」仁宗曰：「有事但以聞，勿以中外為詞。」為黨論者愈益惡之。修妹適張龜正，龜正無子而死，有龜正前妻之女才四歲，無所歸，以俱來。及笄，修以嫁族兄之子晟。張氏後在晟所與奴奸，事下開封府，獄吏附致其言以及修。乃以戶部判官蘇安世、內侍王昭明雜治之，卒無秋毫。乃坐用張氏奩中物買田立歐陽氏券，左遷知制誥、知滁州。久之，遷起居舍人、知揚州，徙潁州。復龍圖閣直學士，知應天府，以母憂去。既免喪，入見，仁宗惻然，怪修發白，問在外幾年，今年幾何，恩意甚至。命判流內銓。小人恐修復用，偽為修奏，乞澄汰內侍兩省挾威令為奸利者。書騰都下，宦者人人切齒，楊永德者陰以言中修，出知同州。外議不平，論救者眾。遂留刊修《唐書》，為翰林學士，加史館修撰，勾當三班院。改侍讀學士、知蔡州，未行，復為翰林學士，判太常寺。

修在朝，以獎進天下士為己任，延譽尉薦，極其力而後已。于經術，治其大旨，不為章句，不求異於諸儒。景中，與尹洙皆為古學。已而有詔，戒天下學者為文使近古，學者盡為古文，而修之文章遂為天下宗匠。蜀人蘇洵嘗論修文章「詞令雍容似李翱，切近適當似陸贄」，而修之才亦似過此二人。人至修作《唐書·志》、《五代史》，敘事不愧劉向、班固也。權知貢舉，文士以新奇相尚，文體大壞，修深革其弊，前以怪僻在高第者黜之幾盡，務求平淡典要。士人初怨怒罵譏，中稍信服，已而文格變而復正。

拜右諫議大夫，判尚書禮部，又判秘閣秘書省，加兼侍讀，辭不受。同修玉牒，兼龍圖閣學士，權知開封府，承包拯威儀之後，一切循理，不事風采。或以為言，修曰：「人材性各有短長，實不能捨所長強其所短。」以給事中罷，同提舉諸司庫務，改群牧使。《唐書》成，拜禮部侍郎，為樞密副使，與曾公亮同力振舉紀綱，革去宿弊，考天下兵數及三路屯戍幾何，地裡近遠，皆為圖籍。未幾，參知政事，預定策立英宗為皇子事，見《韓琦傳》。

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