地質學清楚地表明，各個陸地都曾發生過巨大的物理變化，因此，我們可以預料生物在自然狀況下曾經發生變異，有如它們在家養狀況下曾經發生變異那樣。如果在自然狀況下有任何變異的話，那麼要說自然選擇不曾發生作用，那就是無法解釋的事實了。常常有人主張，變異量在自然狀況下是一種嚴格有限制的量，但是這個主張是不能證實的。人，雖然只是作用於外部性狀而且其結果是莫測的，卻能夠在短暫的時期內由累積家養生物的個體差異而產生巨大的結果；並且每一個人都承認物種呈現有個體差異。

但是，除了個體差異外，一切博物學者都承認有自然變種存在，這些自然變種被認為有足夠的區別而值得在分類學著作中加以記載。沒有人曾經在個體差異和輕微變種之間，或者在特徵更加明確的變種和亞種之間，以及亞種和物種之間划出任何明顯的區別。在分離的大陸上，在同一大陸上而被任何種類的障礙物分開的不同區域，以及在遙遠的島上，有大量的生物類型存在，有些有經驗的博物學者把它們列為變種，另一些博物學者竟把它們列為地理族或亞種，還有一些博物學者把它們列為不同的雖然是密切近似的物種！

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那麼，如果動物和植物的確發生變異，不管其如何輕微或者緩慢；只要這等變異或個體差異在任何方面是有利的，為什麼不會通過自然選擇即最適者生存而被保存下來和累積起來呢？人既能耐心選擇對他有用的變異，為什麼在變化着的和複雜的生活條件下有利於自然生物的變異不會經常發生，並且被保存，即被選擇呢？對於這種在悠久年代中發生作用並嚴格檢查每一生物的整個體制、構造和習性——助長好的並排除壞的——的力量能夠加以限制嗎？對於這種緩慢地並美妙地使每一類型適應于最複雜的生活關係的力量，我無法看到有什麼限制，甚至如果我們不看得更遠，自然選擇學說似乎也是高度可信的。我已經儘可能公正地複述了對方提出的難點和異議：現在讓我們轉來談一談支持這個學說的特殊事實和論點罷。

物種只是特徵強烈顯著的、穩定的變種，而且每一物種首先作為變種而存在，根據這一觀點，我們便能理解，在普通假定由特殊創造行為產生出來的物種和公認為由第二性法則產生出來的變種之間，為什麼沒有一條界線可定。根據這同一觀點，我們還能理解在一個屬的許多物種曾經產生出來的而且現今仍為繁盛的地區，為什麼這些物種要呈現許多變種；因為在形成物種很活躍的地方，按照一般的規律，我們可以預料它還在進行；如果變種是初期的物種，情形就確是這樣。還有，大屬的物種如果提供較大數量的變種，即初期物種，那麼它們在某種程度上就會保持變種的性狀；因為它們之間的差異量比小屬的物種之間的差異量為小。大屬的密切近似物種顯然在分佈上要受到限制，並且它們在親緣關係上圍繞着其他物種聚成小群——這兩方面都和變種相似。

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根據每一物種都是獨立創造的觀點，這些關係就是奇特的，但是如果每一物種都是首先作為變種而存在的話，那麼這些關係便是可以理解的了。

各個物種都有按照幾何級數繁殖率而過度增加數量的傾向；而且各個物種的變異了的後代由於它們在習性上和構造上更加多樣化的程度，便能在自然組成中攫取許多大不相同的場所而增加它們的數量，因此自然選擇就經常傾向于保存任何一個物種的最分歧的後代。所以在長久連續的變異過程中，同一物種的諸變種所特有的輕微差異便趨于增大而成為同一屬的諸物種所特有的較大差異。新的、改進了的變種不可避免地要排除和消滅掉舊的、改進較少的和中間的變種；這樣，物種在很大程度上就成為確定的、界限分明的了。每一綱中屬於較大群的優勢物種有產生新的和優勢的類型的傾向；結果每一大群便傾向于變得更大、同時在性狀上更加分歧。

但是所有的群不能都這樣繼續增大，因為這世界不能容納它們，所以比較占優勢的類型就要打倒比較不占優勢的類型。這種大群繼續增大以及性狀繼續分歧的傾向，加上不可避免的大量絶滅的事情，說明了一切生物類型都是按照群之下又有群來排列的，所有這些群都被包括在曾經自始至終佔有優勢的少數大綱之內。把一切生物都歸在所謂「自然系統」之下的這一偉大事實，如果根據特創說，是完全不能解釋的。

自然選擇僅能藉著輕微的、連續的、有利的變異的累積而發生作用，所以它不能產生巨大的或突然的變化；它只能按照短小的和緩慢的步驟而發生作用。因此，「自然界裡沒有飛躍」這一格言，已被每次新增加的知識所證實，根據這個學說，它就是可以理解的了。我們能夠理解，為什麼在整個自然界中可以用几乎無限多樣的手段來達到同樣的一般目的，因為每一種特點，一旦獲得，就可以長久遺傳下去，並且已經在許多不同方面變異了的構造勢必適應同樣的一般目的。總之，我們能夠理解，為什麼自然界在變異上是浪費的，雖然在革新上是吝嗇的。

但是如果每一物種都是獨立創造出來的話，那麼，為什麼這應當是自然界的一條法則，就沒有人能夠解釋了。

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